本中心籌設於民國七十六年八月,由包含呂世宗教授在內的校內同仁負責推動,民國七十八年八月正式奉准成立,原名為「環境工程研究中心」,呂世宗教授獲聘為首任主任。為因應當時工商業快速成長導致環境污染,研究著重於環境監測與評估。爾後為配合科研發展,自民國八十二年一月奉准更名為「環境研究中心」,各項業務除由既有研究擴及環境規劃和環境污染整治外,並順應國際潮流開始進行全球變遷相關研究,包括溫室氣體排放、氣候變遷模擬及其影響。近年來更積極參與並推動永續發展研究和策略的規劃,同時參與研究的層面,亦由國內服務,漸次擴及至國際交流與合作的具體落實。